Microscopies photonique et électronique, cytométrie et analyse des données : bases théoriques, applicatives et pratiques Présentiel

AXE 10 - Microscopie et imagerie

Environnement scientifique et technique de la formation

Microscopie photonique

Microscopies photonique et électronique, cytométrie et analyse des données : bases théoriques, applicatives et pratiques

Le cours insistera sur les connaissances de base requises pour comprendre les différentes techniques et les applications possibles.

• La Cytométrie: principe, composants d'un cytomètre, la fluorescence et la cytométrie
• Applications cytométrie: cycle cellulaire, apoptose, phénotypage, interaction cellulaire cyto en image, dosage de cytokines, sondes métabolique, tri cellulaire
• La microscopie : Les différents types de microscopie photonique : fond clair, contraste de phase, fluorescence...
• La microscopie de fluorescence : marquage, biosenseurs et applications
• L'échantillon sous le microscope : interaction lumière / échantillon et préparation d'échantillon
• Les différents types de microscopes de fluorescence : performances, avantages et inconvénients
• Présentation des méthodes pour la préparation d'échantillons en microscopie électronique en transmission
• Comprendre les principes de base des microscopes électroniques à transmission
• Principe des microscopes électronique à balayage
• Préparation des échantillons en MEB
• Généralités sur l'analyse de données
• Application à l'analyse d'images

Travaux pratiques (50 % du temps)

Travaux pratiques en petits groupes sur différents appareillages de la plateforme TRI toulousaine (microscopes, cytomètres, stations d'analyse, …)

• Avantages et limites des différents systèmes

À L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires. Envoi d'une attestation de formation.

• Acquérir des bases théoriques sur les techniques
• Connaitre les applications possibles pour chaque technologie
• Aborder l'aspect pratique de ces méthodes

Ressources pédagogiques : supports papier et dématérialisés.

En fin de formation, un test d'évaluation d'acquisition des connaissances sera effectué et une correction collective commentée permettra au stagiaire de se positionner sur l'atteinte des objectifs de la formation.

Microscopes champ large, microscopes confocaux, microscopes multi-photons, microscope à feuille de lumière, cytomètres analyseur, trieurs, cytomètre en image, microscopes électroniques à transmission, microscopes électroniques à balayage.

Si possible, les stagiaires devront amener un PC et installer certains logiciels.