CRISPRi : une application innovante de CRISPR pour la modulation de l’expression génique chez les bactéries Présentiel

AXE 12 - Biologie moléculaire et biochimie

Environnement scientifique et technique de la formation

Laboratoire de microbiologie et de génétique moléculaires

RESPONSABLES

• Catherine TURLAN - Ingénieure de recherche - UMR 5100
• Nathalie EYNARD - Maître de conférences - UMR 5100

CRISPRi : une application innovante pour la modulation de l'expression génique chez les bactéries

PROGRAMME

Cours :

• Systèmes CRISPR, une immunité adaptative bactérienne unique
• Diversité, limites (anti-CRISPR), domestication, application des systèmes CRISPR
• Principe de la modulation transcriptionnelle de l'expression d'un gène par CRISPRi (opéron, gène essentiel, etc.)
• Notions à connaître pour moduler efficacement le niveau d'expression du gène d'intérêt

Travaux pratiques et dirigés :

• Design des ARN guides à l'aide d'un logiciel de clonage (snapgene viewer)
• Préparation des vecteurs d'expression de la protéine Cas et de l'ARN guide
• Transformation d'Escherichia coli et sélection des clones d'intérêt
• Test phénotypique sur boîte
• Quantification de l'expression génique en fonction de l'induction du système CRISPRi

COÛT PÉDAGOGIQUE : 2040 Euros

À L'ISSUE DE LA FORMATION : Evaluation de la formation par les stagiaires, Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE : Réf. 25 234 : du lundi 16/06/25 à 09:00 au vendredi 20/06/25 à 17:00

• Découvrir une nouvelle stratégie de génie génétique pour moduler l'expression d'un gène bactérien sans modifier sa séquence
• Comprendre la domestication des systèmes CRISPR (CRISPR interférence) pour la modulation de l'expression génique (CRISPRi)
• Définir le gène cible et l'ARN guide
• Construire le(s) plasmide(s) permettant de moduler l'expression du gène d'intérêt
• Utiliser un logiciel de clonage et d'analyse des génomes bactériens

• Alternance de cours (10 h) et de travaux pratiques et dirigés (25 h)
• TP mis en place par un technicien et encadrés par une intervenante pour 4 stagiaires maximum
• Tout au long de la formation, des cas pratiques ou exercices corrigés permettront à l'apprenant d'évaluer son acquisition des connaissances.
• Un support papier et un fichier au format PDF seront mis à disposition du stagiaire.

Matériel standard d'un laboratoire de biologie moléculaire et de microbiologie

Il est demandé aux stagiaires de se munir de leur propre ordinateur portable avec les droits administrateurs afin de pouvoir installer en début de stage les logiciels nécessaires à la formation.

Evaluation de la formation par les stagiaires

Envoi d'une attestation de formation