ImageJ / FIJI : traitement et analyse d’images de microscopie Présentiel
Dernière mise à jour : 01/10/2025
Description
AXE 10 - Microscopie et imagerie
Environnement scientifique et technique de la formation
Traitement d'images
ImageJ/FIJI : traitement et analyse d'images de microscopie
PROGRAMME
- Jour 1 :
- Introduction aux images numériques (Cours/Echanges)
- Installation et configuration d'ImageJ-Fiji (Cours/Echanges)
- Ouverture et visualisation des images (Pratique/Echanges/Exercices)
- Création d'une planche d'images pour la publication (Pratique/Echanges/Exercices)
- Traitement des images tridimensionnelles (Pratique/Echanges/Exercices)
- Traitement des images numériques (Pratique/Echanges/Exercices)
- Quantification des images numériques (Pratique/Echanges/Exercices)
- Initiation au tracking d'évènements dynamiques (Pratique/Echanges)
- Initiation à la mesure de colocalisation (Pratique/Echanges)
- Initiation à l'automatisation (Pratique/Echanges/Exercices)
- Travail sur les problématiques et images des participants (Pratique)
À L'ISSUE DE LA FORMATION
Evaluation de la formation par les stagiaires. Envoi d'une attestation de formation.
DATE DU STAGE
Réf. 25 390 : du lundi 03/02/25 à 09:30 au mercredi 05/02/25 à 17:30
Objectifs de la formation
- Connaitre les propriétés des images numériques
- Effectuer des montages pour publier des figures de microscopie
- Acquérir les bases du traitement d'image (réduction du bruit, alignement)
- Acquérir les bases de la quantification des données provenant d'images (dénombrement, mesure de taille et forme)
- Aborder des applications avancées en analyse d'image (tracking, colocalisation, automatisation)
Public visé
Prérequis
Modalités pédagogiques
Cours interactifs (2 h) et travaux dirigés (19 h) animés par un intervenant pour 5 stagiaires maximum.
Un support papier comprenant tous les cours et les TP sera remis aux participants, ainsi qu'une clé USB comportant les versions numériques des présentations et les outils d'analyse d'image.
Tout au long de la formation, des quizz permettront de reprendre ensemble les différentes notions rencontrées lors de la formation et une correction collégiale commentée permettra à l'apprenant de se positionner sur l'atteinte des objectifs de la formation.