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Caractérisation des protéines par spectrométrie de masse en protéomique bottom-up Présentiel
Dernière mise à jour : 15/09/2026
Unité de recherche
Description
Formation théorique (50 % du temps environ)
- Préparation d'échantillon, digestion
- Techniques d'ionisation des macro-biomolécules d'intérêt biologique : ESI, MALDI
- Analyseurs : TOF(-TOF), quadripôles, trappes d'ions, hybrides, FT, Orbitrap et Astral
- Mobilité ionique
- Couplage HPLC et nano HPLC
- Mesure de masse moléculaire (MS), et séquençage en MS/MS (mode DDA, DIA)
- Peptides, règles de fragmentation, interprétation des spectres MS/MS et identification de modifications post-traductionnelles
- Outils informatiques pour les recherches dans les banques
- Introduction à la quantification différentielle par MS (SILAC, TMT, label free)
Travaux pratiques (50 % du temps environ)
- Identification de protéines par spectrométrie de masse : de l'échantillon protéique à son identification par spectrométrie de masse
Objectifs de la formation
Acquérir les bases théoriques et pratiques de la protéomique bottom-up :
- préparation et traitement d'échantillons,
- analyses en spectrométrie de masse,
- obtention et interprétation de spectres MS/MS pour séquençage peptidique,
- identification de protéines et de modifications post-traductionnelles,
- quantification relative de mélanges,
- comparaison des approches analytiques et initiation aux recherches dans les bases de données.
Public visé
Techniciens supérieurs, ingénieurs, chercheurs, doctorants.
Prérequis
Connaissances de base en biochimie et en techniques analytiques
Modalités pédagogiques
Formation en présentiel, alternant sessions pratiques, cours théoriques et travaux dirigés.
Moyens et supports pédagogiques
Mise a disposition des supports projetés et d'un cours rédigé sur clé USB.
Equipements :
- Spectrométrie de masse : 2 hybrides nanoESI quadripôle-Orbitrap QExactive et QExactive-HF, 1 tribride nanoESI trappe ionique-Orbitrap-Astral, 1 tribride nanoESI trappe ionique-quadripole Orbitrap Eclipse, 1 source TriVersa NanoMate Advion, 1 MALDI TOF-TOF 5800
- Nano chromatographie en phase liquide : 4 chaînes nano RSLC U3000, une chaine HPLC Vanquish, 2 chaine nanoLC neoVanquish
- Logiciels disponibles : Mascot, Peaks, Byonic, MaxQuant, Proteome Discoverer, myProMS, Perseus, DIANN, Spectronaut, Chimerys, FragPipe
Modalités d'évaluation et de suivi
Un suivi individualisé par des évaluations formatives est assuré. Une attestation de fin de formation est délivrée à la fin du parcours.
Formateurs
EN
ESKENAZI Nicolas
Responsable scientifique
VJ
VINH Joëlle
Responsable scientifique
Informations sur l'admission
L'admission à cette formation ne fait l'objet d'aucun examen, test ou sélection préalable ; l'inscription est validée après réception du dossier complet et confirmation par l'organisme de formation.
Modalités tarifaires spécifiques
Nos formations sont exonérées de TVA. Elles bénéficient de remises volumes : - 5% pour 3-4 inscrits, - 10% pour 5-6 inscrits, et - 20% à partir de 7 personnes. Une réduction de 20% est appliquée pour les agents salariés du CNRS.
Informations sur l'accessibilité
Notre organisme s'engage à garantir l'accessibilité de ses formations à distance et en présentiel aux personnes en situation de handicap. Un référent handicap est mobilisable afin d'analyser les besoins spécifiques et de mettre en place, lorsque cela est possible, les adaptations pédagogiques, techniques ou organisationnelles nécessaires.