Spectrométrie de masse pour l’analyse de molécules biologiques Présentiel

1er jour

• Rappel des bases de la spectrométrie de masse : mesure de masse, diversité de l'instrumentation, principaux analyseurs, choix d'une instrumentation adaptée
• Sources d'ionisation pour l'analyse de biomolécules : ESI, APCI, MALDI
• Analyse de peptides par spectrométrie de masse
• TP : analyse de peptides et protéines sur un instrument de type Q-TOF

2ème jour

• Préparation des échantillons : précautions et généralités. NB : cet aspect du programme fera l'objet d'une journée de formation dédiée.
• Analyse de métabolites par spectrométrie de masse : approches ciblées ou globales (métabolomique)
• TP : analyse de métabolites par GC-MS

3ème jour

• Principes guidant la fragmentation des molécules biologiques : modèle du proton mobile et application à la fragmentation des peptides, oligosaccharides et oligonucléotides
• Imagerie moléculaire de biomolécules
• Analyse d'oligosaccharides par spectrométrie de masse
• Analyse de protéines par spectrométrie de masse : étude de complexes en conditions natives, séquençage par approches top-down

4ème jour

• Mobilité ionique couplée à la spectrométrie de masse
• Approches quantitatives et analyses statistiques des données de spectrométrie de masse
• TP : séquençage de peptides
• Table ronde et bilan avec les participants

Ce stage peut-être poursuivi par une journée de formation (le vendredi) : "Préparation des échantillons pour l'analyse de protéines et de peptides par spectrométrie de masse".

• Alternance de cours et exemples d'application (15,5 h) et de TP (10,5 h)
• TP en sous-groupes de 3 participants